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2019年5月5日星期日

【视频】Evo-Devo (Despacito Biology Parody) | A Capella Science 科學版 中文字幕







03:26 應該是從孑孓到蚊子




註一:00:07 湯瑪士 亨利 赫胥黎(Thomas Henry Huxley,1825~1895),英國生物學家,以生源論及無生源論廣為人知,因捍衛部份達爾文進化論而被冠上 達爾文的走狗 的稱號。片中為他的著作:達爾文假說(Darwinian Hypothesis)。
註二:00:10 芭芭拉 麥克林托克(Barbara McClintock,1902~1992),美國遺傳學家,致力於玉米細胞遺傳研究,提出轉座子的概念,但因太前衛未被世人接受,十年後分子生物學證其正確性,她因此獲頒1983年諾貝爾生醫獎,為唯一獲此殊榮女性。片中為她的著作:玉米的染色體構成(Chromosomal Constitution of Races of Maize)。
註三:00:12 西恩 卡羅爾(Sean B Carroll,1960~),美國演化發生學家、作家、教育家及製片人,主要研究順式作用元件對基因表現的影響。片中為他的著作—蝴蝶、斑馬與胚胎:探索演化發生學之美(Endless Forms Most Beautiful)。
註四:00:16 史蒂芬 傑伊 古爾德(Stephen Jay Gould, 1941~2002),美國古生物學家、演化生物學家、科學史學家及科普作家,與尼爾斯 埃爾德里奇 共同提出間斷平衡理論,因此享譽全球。影片中為他的著作:個體發生與系統發育(Ontogeny and Phylogeny)。
註五:00:17 埃里克 戴維迪生(Eric H Davidson,1937~2015)及伊莎貝爾 彼得(Isabelle S Peter,找不到出生年,但她還活著)。片中為他們的合著—基因組控制過程:發育與進化 (Genomic Control Process: Development and Evolution)。
註六:00:23 後面的細胞們分別是神經元(neuron)、心肌細胞(myocardiocyte)、配子細胞(gamete,但圖是精子細胞sperm)、白血球細胞(leukocyte,分成嗜中性球neutrophil, 嗜酸性球 eosinophil, 嗜鹼性球basophil, 淋巴球 lymphocyte, 單核球 monocyte)、骨細胞(osteocyte)、紅血球細胞(erythrocyte)、錐狀細胞(cone cell)。
註七:00:43 hox (hox gene) 同源異形基因 負責調控生物形體的基因。
註八:00:47 genetic tool應該指的是因基因所造出的蛋白質們 不是指基因。




註九:00:59 interface指介面,即把自己表現給外界的物體,這裡就是指表現型(介面)把基因型(內部物件,這裡用子程式、檔案)表現出來,為了配合介面、子程式之類的電腦用字,後面的字也用電腦用字(circuit board和boot code) 。
註十:01:01 evo-devo (evolutionary developmental biology之簡稱),演化發育生物學,簡稱演化發生學,這裡不翻是因為翻出來很怪。
註十一:01:08 coding sequence, 編碼區,可以製造出蛋白質的一段DNA或RNA序列。Cis-regulatory element, 順式作用元件,可以調控影險基因表達的一段核酸序列,如啓動子、強化子。
註十二:01:11 話說veto是否決、覆議的意思,公民課剛好有教,然後enhance就是指強化子(enhancer)。
註十三:01:19 英文很厲害的人可能發現labyrinthal這個字很怪,好像不是labyrinth的形容詞誒,應該是labyrinthine才對吧?但其實labyrinthal的確是labyrinth的形容詞之一,只是幾乎不用這字而已啦。
註十四:01:27 上面那一串東西是胚胎到成體時,在這過程中影響各段過程的基因,然後底下那個(D.melanogaster)是黑腹果蠅,學名Drosophila melanogaster。
註十五:01:31 上面那一串是hox基因群,底下那隻老鼠頭那個M.musculus是小家鼠,學名Mus musculus。01:34 Urbilateria是兩側對稱動物最老共祖,ur是德文original的意思,bilateria是兩側對稱動物。
註十六:01:37 torpedo 是用魚雷轟爆的意思。
註十七:01:43 獨眼羊,因為獨眼羊的母親在受孕時誤時到過多加州藜蘆,這種植物含有環杷明(cyclopamine),會阻擋smoothened蛋白的傳訊,進而妨礙前腦分裂導致獨眼,詳細說明去看註二十一,我不建議去搜尋 cyclopic sheep,因為照片實在不麼好看。TED有介紹這事情,網址在這:https://www.youtube.com/watch?v=Fzz-P...
註十八:01:47 drosophila其實是果蠅”屬”。




註十九:01:49 這個也是黑腹果蠅,上字幕時沒注意到~
註二十:01:53 這裡是指寒武紀大爆炸(Cambrian explosion)。上面那三個生物分別是:怪誕蟲(hallucigenia)、花邊蟹(marrella)和海口魚(Haikouichthys)
註二十一、二十二:01:58, 02:00 刺蝟訊息,這東西要解釋很久。我們細胞內有一段基因叫刺蝟基因,叫刺蝟基因是因為科學家把果蠅的它關掉後那隻果蠅就變的又短又胖又很多毛,長得像刺蝟,這個刺蝟基因會使細胞製造刺蝟蛋白並釋放它出去,就是刺蝟訊息,共有六種,其中有兩個叫音蝟因子(Sonic Hedgehog)和印度刺蝟因子(Indian Hedgehog),恰恰好的是,動物刺蝟也有一個種叫印度刺蝟,而且,音速小子(Sonic)也是刺蝟,所以寫詞的故意這樣寫,言歸正傳,刺蝟因子會刺激細胞上的patched受體,讓它傳訊給smoothened蛋白,而它會是放訊號告訴細胞要變成什麼組織,變成甚麼組織依照訊號而定,而訊號取決於刺蝟因子的濃度,而環杷明會和smoothened基因結合使它無法接收patched受體的訊號,才會有獨眼羊。
註二十三:02:07 這句硬翻的話應該翻成從”發育到進化”,但翻成”從出生到死亡”比較適合。
註二十四:02:20 上面那個是螯龍蝦屬(Homarus)。歌詞中的另我(alter ego)是指每一個部位都有一個另我(指基因),本來另我指另一個自我,通常跟自我有很大的差別,就是精神分裂症啦,但這邊指部位和對應基因的關聯性和差異性,就是動了那基因就像動了那部位,可是那部位跟基因差很大。
註二十五:02:21 這邊有一篇文章,把homolog講解的超級清楚:http://pushkin.pixnet.net/blog/post/1... 但如果硬要我解釋的話,總結來說,homolog(同源基因)是ortholog(直系同源基因)和paralog(旁系同源基因)的合稱,ortholog是生殖隔離後原本同種演化成不同種,原本相對應的基因也發生變化而有細緻的差別了,這對基因就是彼此的ortholog,而paralog是同個種內,一群由同個基因祖先複製出來的多個基因,這堆基因就是對方的paralog。還是去讀文章最清楚啦~
註二十六:02:22 我挖了老半天,找不到對schema合理的正確翻法,就姑且當它是細微處好了,如果有找到合適的schema意思,麻煩留言給我,我想看啊~。上面那隻動物叫雅烏尼克蟲(yawunik),迄今發現最古老的節肢動物。
註二十七:02:27 如果當天不想吃飯就搜尋”fly with legs on its head”。



註二十八:02:32 現代綜論(Modern Synthesis)是達爾文演化論(Darwinian theory)和孟德爾遺傳學(Mendelian genetics)結合而成,所以下下句才說”只是兩個理論結合,竟然可以變成一個新學科”。
註二十九:02:33 翻成生物的續集是因為結合達爾文演化論和孟德爾遺傳學代表把基因與外在特徵的變化結合了,所以才叫續集。
註三十:02:35 胚胎學(Embryology)和微生物學(Microbiology)結合成發育生物學(Developmental biology)
註三十一:02:38 發育生物學和現代綜論結合成演化發育生物學。Amigo 是西班牙文”朋友” 註三十二:02:48 模塊化在這指把步驟簡化(原本得修改基因變成開關基因)
註三十三:03:04 話說cheat code是一個band誒,作弊碼三人組。
註三十四:03:10 遠端胺基酸(distal amino),我猜是硒半胱胺酸或者是吡咯賴胺酸等氨基酸,分別由密碼子UGA和UAG序列轉譯而成,有時這兩段序列會充當中止密碼子的功能—在轉譯過程中生成硒半胱胺酸或吡咯賴胺酸於新生蛋白質的某處,並使之失去功能,這邊就是某氨基酸使某蛋白質失去效用,並中止那段蛋白質的任務:生成腳。
註三十五:03:21 在寫註解的時候突然發現,”Life in variation endless and beautiful.”這段歌詞是化用 Sean B Carroll的著作Endless Forms Most Beautiful誒。03:23 話說Badaboom是款遊戲的樣子。
註三十六:03:29 這裡的glow tag是指一種生科技術,把一段核酸單鏈片段裝上螢光蛋白後丟到細胞核裡,它就會去抓特定某序列的DNA,然後從螢光顯微鏡上就會發現那邊亮亮的。
註三十七:03:31瑪啉基(morpholino),又叫瑪啉,是一段單鏈的核酸片段,它會和mRNA約莫二十五個鹼基對結合,並妨礙那段mRNA與其它分子結合,使它失去效用。




註三十八:03:33 寡核苷酸(片中的short oligo,全名oligonuecleutide),是一段二十個鹼基對短鏈核苷酸總稱,它們很容易與它們的互補鹼基段連結,所以常拿來當作探針使用,瑪啉就是一種寡核苷酸。
註三十九:03:37 Beagle是小獵犬號。補充一下,03:38 body plans其實是故意把body plan拆開的,body plan是指體型呈現,是一生物分類方法,像側生動物、真後生動物等。
註四十:03:43 aesthetica in vivo其實是一本義大利文的書,直翻叫”體內之美”。
註四十一:04:00 這邊的the other Sean Carroll是在說Sean M Carroll,一個宇宙學家。

视频摘自【Alien Lin Ethan】
Published on Dec 16, 2017 https://www.youtube.com/watch?v=aFo2cd_ESpw

https://www.youtube.com/watch?v=ydqReeTV_vk


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